Так и делаем, но тогда предупреждайте пользователей что если они раздвигают строчки в экселе, то может измениться количество листов, и их количество необходимо вручную исправить в соответствующем пункте накладной.

Совершенно верно. Я в приписке к счету всегда указываю что применяю УСН, и не выставляю счет фактуру. Это упрощает дальнейшие вопросы. Вот и хочется не каждый раз его один и  тот же вставлять, а сделать так что бы он всегда по умолчанию уже был во вновь создаваемом счете.

Вот как выглядит счет и накладная на него. Четвертая позиция в счете отображается полностью. в накладной обрезается.

Стоимость жестких дисков в настоящее время относительно не велика. 

Затраты контура, покрываются нашими платежами. К примеру бэкап можно делать за доп плату, я с удовольствием бы платил какую то обозримую сумму за спокойный сон по ночам.

А меня больше заботит другой вопрос. У меня счета в Эльбе делают менеджеры, а если кто то из них затаит обиду и поудаляет важные документы? Как это восстановить? Хороша была бы возможность откатываться на резервную копию на день, неделю назад.