Так в НК нет понятия юр. адреса и физ. адреса - есть адрес местонахождения юр. лица. А когда вы указываете оба адреса, то по физ. адресу вы должны встать на учет в местной налоговой как обособленное подразделение и уже использовать только тот адрес. А как обособленное подразделение, я так понимаю мало кто встает на учет и в итоге подставляют сами себя. 

Когда уже? Разве так сложно, что б после уплаты налога, создалось решение учредителей, п/п на уплату НДФЛ и п/п на перечисление дивидендов учредителям? 

Что мешает выставлять счета на основе предыдущих? и будет вам счастье)

Открывайте любой предыдущий счет и выбирайте функцию "копировать", у вас создаться новый счет, с теми же приписками как в старом.