Если покупатель выдал к товарному чеку еще и кассовый, то в поле платежный документ поставьте "касс.чек". Если кассового чека нет, то поле платежный документ заполнять не нужно, т.к. товарный чек не является документом подтверждающим оплату.

В счете не должен указываться ИНН и КПП заказчика, т.к. счет выставляется заказчику для того, чтобы он знал по каким реквизитам перечислять оплату исполнителю. Что касается номенклатуры товара, то пока это перспективные планы.