Как рассчитывается налог по источнику?

С 2016 года налоги считаются при выплате дохода в кассовой ведомости с полной суммы дохода включенной в текущую +предыдущие кассовые ведомости по всем источникам.

Если в настройке "Учет предыдущих ведомостей" (Настройка -> 5. Настройки таблиц и форм печати -> 3. Настройки платежных (кассовых) ведомостей)  указано 0 то НДФЛ считается в лицевом счете по следующему алгоритму:

1. Берем сумму дохода с начала года по месяц предшествующий рассчитываемому по всем источникам
2. "Считаем" виртуально (а не берем посчитанную) с этой суммы налог (т.е. получаем идеальную сумму налога с выбранной суммы дохода)
3. к (1) добавляем доход по источнику расчетного месяца
4. считаем налог с (3)
5. Вычитаем (2) из (4) получаем налог расчетного месяца.