Заходите в раздел "Бизнес"/"Исходящие документы", нажимаете на "Договор" и "Создать новый", делаете свой шаблон и сохраняете. При следующем нажатии на создание "Договора" в списке будет отображаться Ваш шаблон с названием, которое вы ему присвоили. Примерно так: http://clip2net.com/s/58E7t0  

На другой р/с своей организации?

Отразить в системе так:

1. Завести оба расчетных счета в системе

2. Сделать списание с одного р/с с типом операции "Перевод между своими счетами"

3. Сделать поступление на другой р/с с типом операции "Перевод между своими счетами"

Платежку сделать можно, если заведете себя как контрагента.

Чем больше пользователей поддержат данную идею, тем быстрее мы реализуем данную функциональность

В ближайших планах, к сожалению, нет такой задачи.

Как часто происходит такая ситуация у контрагентов? К сожалению, не ясно, на сколько это полезная функция, и на сколько она востребована.

Сейчас в разработке другие задачи (те, у которых больше голосов).

Чем больше пользователей поддержат данную идею, тем быстрее мы реализуем данную функциональность.