Всё подробно описано в знании

Если установить разъездной характер работы, сотрудник не получит командировочные

Но получит заработную плату такую же, как "сидячий", и даже чуть больше, поскольку в её состав войдёт доплата за разъездной характер работы. По факту "несправедливой" разницы в размере отпускных не будет.

по факту он в любом случае находится в командировке.

Нет. 

Сотрудник, которому согласно ЛНА организации установлен разъездной характер работы, и который выполняет свою обычную работу, не считается командированным.

З.Ы. Изначальный вопрос был "Кто прав?". 

Вам ответили: прав неведомый разработчик, Вы не правы. 

СДЗ Иванова = 1000 / 9.45 =105.82

Нет.

Такой расчет нарушает требования законодательства (конкретно - п.18 ПП 922).

105.82 < МРОТ/29.3, поэтому СДЗ Иванова = МРОТ/29.3 = 656.72.

Видимо, вы этот нюанс при расчёте не учитываете и в результате "страдают" работники.

у сотрудника, который работает столько же, а получает отпускные намного меньше.

Ну не на много, но, всё же, меньше. И да, вопросы возникают. 

"Не жадные" работодатели решают их довольно просто. Например, доплачивают разницу м-ду средним и фактическим заработком.

В вашем случае достаточно просто правильно посчитать отпускные и вопросов сразу станет меньше. 

Если же решать вопрос более "глобально", то водителям, которые регулярно ездят в командировки с понедельника по пятницу, можно установить разъездной характер работы. В этом случае их поездки командировками считаться не будут и отпускные Иванова и Петрова из примера выше автоматически уравняются.

Разработчик утверждает, что при расчете дней, для расчета среднего за этот месяц следует использовать формулу 29,3*(31-21)/31 т.е. 9,45 дней

Утверждение разработчика полностью соответствует сказанному в п.10 ПП 922 "Об особенностях порядка исчисления средней заработной платы":

Количество календарных дней в неполном календарном месяце рассчитывается путем деления среднемесячного числа календарных дней (29,3) на количество календарных дней этого месяца и умножения на количество календарных дней, приходящихся на время, отработанное в данном месяце.

т.е исключать из расчета среднего только дни командировок и оставлять выходные.

Конечно.

Периоды, дни которых исключаются из расчета, перечислены в п.5 ПП 922. Выходные там не упоминаются.

средняя дневная зарплата по моей логике ЗПоОкладу/(29.3/31)

Более чем странная логика...

сотрудник, который сидел на работе получит отпускных в 9,45 раз больше, чем тот кто ездил в командировку

Откуда такая математика?

Давайте посчитаем.

Дано: 

Иванов и Петров устроились на работу 01.08.2024 с окладом 22000 и пошли в отпуск с 01.09.2024. Иванов в августе отработал 1 день, всё остальное время (кроме выходных) провёл в командировках. Петров весь август "сидел на работе".

Расчёт:

Расчётный период - август 2024.

Заработок Иванова = 22000/22*1 = 1000

К-во отработанных дней в августе = 29.3*(31-21)/31 = 9.45 

СДЗ Иванова = 1000 / 9.45 = 656.72

Заработок Петрова = 22000/22*22 = 22000

К-во отработанных дней в августе = 29.3

СДЗ Петрова = 22000/29,3 = 750.85

Т.о. "сидячий" Петров получит отпускных всего в 1.14 раз больше, чем "разъездной" Иванов.

Здравствуйте.

Выходное пособие КЗ предложит рассчитать в момент увольнения (надо ввести к-во дней оплаты по среднему):

После расчета в ЛС появится 147 вид с начисленной суммой.

Дополнительную компенсацию в размере среднего заработка можно рассчитать двумя способами:

1. В режиме "Отпуск, расчет по среднему", выбрав "Расчет среднего за период":

Далее надо указать вид начисления, в который КЗ положит результат расчета:

2. Добавить в ЛС вид начисления с алгоритмом 7 (в поставке - 107), указать для него даты начала и конца, соответствующие датам начала и конца периода оплаты, процент оплаты, после чего просто рассчитать ЛС.

Это только у одного сотрудника, бухгалтер попросил так сделать

Если не сложно, можно подробнее (уже просто интересно...)?
Какой смысл вносить в кассу сумму, равную начисленному НДФЛ по 345 виду?

Как мне настроить в КЗ, чтобы показать эту сумму, как НДФЛ удержанный на определенную дату?

Чтобы вид "Возврат в кассу" попал в 6-НДФЛ как начисленный и удержанный на определенную дату налог, необходимо настроить его как вид налога (символ "Н" в столбце "Доп" в настройке налога") и разнести по нему дату выплаты. Вот только в строке 140 6-НДФЛ при этом будет сумма налога, исчисленная с суммы матвыгоды, а в строку 160 попадут сумма по виду 345 и сумма, внесенная в кассу. В результате в строке 180 появится сумма излишне удержанного налога. В чём прикол? М.б. я чего-то не понимаю?

Зачем?

Вы УЖЕ удержали с него НДФЛ по 345 виду. 

Здравствуйте.

Как настроить в КЗ, чтобы эта выплата отражалась в 6-НДФЛ

О какой  выплате идёт речь? Внесение в кассу "выплатой" ни как нельзя назвать...

Выплатой в данном случае может быть только процент с выданной работнику ссуды (если речь, конечно, именно о ссуде) . В 6-НДФЛ должны попасть сумма именно этой "псевдовыплаты" и НДФЛ с неё. 

Давайте по порядку.

Во-первых, обязанность уплаты НДФЛ лежит не на работнике, а на работодателе.

Во-вторых, для того, чтобы у работодателя появилась необходимость удержания/уплаты НДФЛ, работник должен получить налогооблагаемый доход. В отношении НДФЛ с  выгоды, в КЗ эта "цепочка" реализована таким образом:

Внесение в кассу некой суммы не является удержанием с работника НДФЛ. Это добровольное пожертвование от работника в пользу организации, которое в 6-НДФЛ не отражается ни как ;)

где надо было в определенных позициях расставлять + и -

А про минус можно подробнее? Он для чего? В "послании для потомков" про него ни чего нет

"+" в определенной позиции Комментария 2 устанавливает функционал настраиваемого поля таблицы свода. Подробнее читайте тут: Танцы с бубном в сводах.txt