Статусы счету реализовали по просьбам наших пользователей - http://elba.userecho.com/topic/46171-status-scheta...
Акт сверки строится исходя из заведенных актов и накладных, а также денег.

Да, действительно есть отличия между версиями, в дальнейшем это будут два разных сервиса, которые никак не будут связаны, т.е. развиваются отдельно друг от друга.

Акт сверки создается в каждом контрагенте, бизнес - клиенты и поставщики, открываете контрагента, нажимаете на создать новый (акты сверки), также его можно распечатать/сохранить.

К сожалению материальная выгода не реализована в нашем сервисе. Чем больше пользователей поддержат данную идею, тем быстрее мы реализуем данную функциональность.