Поддерживаю, но лучше назвать статус "Удален" или "Отменен" и сделать не только для счета, но и для накладной и акта.

Поддерживаю, 5 выписок мало, может быть стоит сделать вариант с накоплением? Другими словами каждый месяц их число увеличивается на 5, с максимальным ограничением в 10-15 штук. Например, на начало первого месяца их было 5 и, в течение месяца, потрачено 3, тогда на начало второго месяца их уже 7 (2 остались из прошлого и +5 новых) и т.д.
Это не решает проблему при необходимости большого числа выписок в месяц (т.е. платная услуга все равно нужна), но позволит сталкиваться с ней немного реже тем, кому изредка надо превысить лимит в 5 штук. Кроме того, подобный функционал потребует не столь значительных изменений как ввод платной услуги.

1. Автоподстановка которая сейчас реализована, очень удобная и хотелось бы использовать ее в будущем, совместно с каталогом (автодобавление позиций в каталог и автоподстановка из него).
2. Единственный минус автоподстановки в том, что она должна быть редактируемой/отключаемой. Сейчас каждый месяц нужно делать несколько актов с большим количеством уникальных позиций (суммарно, до тысячи наименований), шанс повторного использования которых практически нулевой. В данный момент при сохранении акта с более чем 200-300 позициями, выпадает ошибка сервера с таймаутом, при этом акт сохраняется. Почти на 99,9% уверен, что это из-за индексации позиций для автоподстановки. Очень бы хотелось иметь возможность, на странице создания счета/акта, отключать саму автоподстановку и сохранение введенных позиций для нее, т.к. при работах типа "Устранение неисправности по Заявке №20110810001", автоподстановка только мешает и приводит к ошибкам.