как настроить выплату и ндфл по основ ному и совместительству а также видам источников

Добрый день.

Запрос "формировать ведомости по источникам" - понятен  и тут проблем никаких нет ( у вас же поводиться в ЛС баланс по источникам?) 

А для чего вам выплата по "должностям"?

СОВМЕСТИТЕЛЬСТВО ОНА НЕ КОРРЕКТНО ЛОЖИТСЯ по основному будет переплата в а по совместительстве недоплата 

Плохо понимаю о чем речь.

Выложите сохраненку с конкретным ЛС и распишите что и как вы хотите получить