Составьте "наборы" 

1)Аванс в Убрир

2)Зп в Сбер

3)ЗП в ВТБ 

и формируйте ведомости по наборам ЛС..

Реестр формируется без сортировки по банкам (все сотрудники в одном реестре)

А как должно быть?

Выдача аванса в один банк, а заработной платы в другой.

У вас все сотрудники получают аванс?

Аванс в один банк отправляется?

Какая тут "сортировка" должна произойти?

Отключите запрос..

Скорей всего достаточно взять поставочный  user\USKASLIB.S

USKASLIB.S

1) (Настройка)->"8. Настройка кадровой части"-> Настройка изменяемой кадровой части

Тут для каждого банка добавляем отдельное поле к.ч. ...

Примерно вот так:

2)Есть знание

Если у вас сразу 2 банка в к.ч. указано, то вам диалог и не нужен..

Диалог позволяет "отфильтровать" из ведомости лишние ЛС ( например, хотим сформировать ведомость только по тем ЛС, у которых заполнен номер счета для сбера)

Какой из этих 3 пунктов вызывает проблему и нужно описать подробнее?

Добрый день.

Уточните ваш вопрос..

Добрый день.

Неверно указаны даты приема/увольнения

Добрый день.

Вы случайно не игрались с настройкой?:

(проверьте что она пустая)

"Нестандартный адрес сервиса ЭЛН" (Настройка -> 4. Настройки параметров расчета -> 4. >>> Настройки для больничных -> 2. Настройки для сервисов ЭЛН и СЭДО ФСС)