• Выделяем ЛС
• Работа - Отпуск- Расчет отпуска
• Появится запрос  "Выбор параметров для расчета среднего"
• Нужно выделить должность, по которой производится увольнение + совмещение для этой должности
• "Тип отпуска" - укажите "Компенсация ув."

Нет не в этом.

При передаче по Shift+F8 создается новая таблица и дата создания должна подтягиваться текущая.

Давайте уточним про дату в каком диалоге мы говорим? 

При передаче по shift+F8 сначала предлагает распечатать...

При этом показывает 2 диалога: "большая панель" + "введите дополнительные данные"

Потом предлагает выполнить передачу в файл и показываете "большую панель"

Значит какой то сертификат ФСС отбраковывает...

Попробуйте указать в каждой настройке "сертификат организации"

выложите сохраненку с ЛС, посмотрю почему не считает

В настройке "сертификат главного бухгалтера" и "сертификат руководителя" у вас указан один и тот же сертификат ( сертификат организации)?

Для совмещения не нужно заводить отдельную исполняемую должность. 

В рамках основной должности добавляете вид "совмещение"...

Если вы все же завели отдельную исполняемую должность для совмещения, то при расчете увольнения нужно выбрать "Все исполняемые должности", тогда суммы начисленные по совмещению попадут в расчет среднего.

Добрый день.

Можете уточнить - вторая должность у вас совмещение или совместительство?