Разница у вас по этим сотрудникам

Сумма дохода кратна размеру вычета -> судя по всему вычеты корректировали "задним числом" ( после того как налог уже был удержан)

Добрый день.

Вы бы хоть немного "поработали" сами и локализовали проблему до ЛС по которому у вас вопрос?

Зачем всю базу выкладывать?

ЛС с расхождениями легко отлавливаются с помощью реестра 

Такая разница у вас?

Добрый день.

У 341 в 18 столбце спец ТВХ должна стоять *

Добрый день

Файлы с настройкой доп реквизитов находятся в каталоге 

..ZPL\TABL_R\

Поищите файлы в архивах.. ну или возьмите из поставки, если не вносили изменения

Добрый день

Информации для ответа почти нет..

Выложите скриншот по каждому пункту ( что и в каком порядке делаете)

Добрый день!

С вероятностью 99% вид указан в одной из настроек налога прошлых лет..