"Не верю!" (c)

Выложите сохраненку с ЛС в котором есть суммы не попадающие в свод.

Настройка в 624.7 есть 

По умолчанию налог НЕ отбрасывается.

Вам надо поставить 2, если вы не хотите, чтобы в ЕНП попал налог не проведенный через ведомость.

Правильно понимаю, что проблему решили и вопрос можно закрывать?

Чтобы мнимый вид попал в свод его надо пометить в 12 столбце спец ТВХ

Ответ тут

В настройке 205 алгоритма такие настройки?

Если настройки верные, то выложите сохраненку с "неразберихой" и подробно напишите какие суммы вам не нравятся ( и какие суммы вы ожидали от программы)

Дублирую ссылку:

https://kontur.userecho.com/knowledge-bases/51/articles/10584-kak-raznesti-v-summu-datu-vyiplatyi

Вот она в предыдущем посте

В посте выше есть ссылка. 

Там подробно описано что и как