Нет ничего сложного:
TABLREF\formbl1.txt, formbl2.txt - формы отвечающие за печать этой справки.
formbl2.txt копируем в formbl2.usr и либо вносим коректировки прямо там, либо (если это эксель) еще делаем пользовательскую копию formbl.s и вызываем из formbl2.usr поправленный вариант печати. Что надо, то и правите.

Вариант еще проще (конкретно для вашей формулировки задачи): заменить шаблон экселевский TABLREF\formbl.xlt на свой. Где у 62 и 63 строчки, и 66-68 сделать нулевую высоты строк. Тем самым выплаты за счет ФСС и итоговой суммы будут не видны в напечатанном виде, а значит расписываться за "суммы ФСС" не придется..

Можно увидеть протокол ошибки?
Вообще говоря ФСС видит ЭЛН и информацию в ЭЛН. 
Мы переносим в реестр ПВСО информацию из ЭЛН 1 в 1 (речь пока про ЭЛН в формате 1.0 и реестр версии 1.7.6).
Вариантов перенести "не так" нет. В каком виде нам ЭЛН 1.0 отдали, в таком виде в ПВСО мы его и зафигачим. Отсебятины там не может быть. Потому что это та часть которая заполняется ЛПУ.
То что в Экстерне по-другому - это ЭЛН в формате 2.0.
Так что вполне возможна ошибка внутри ФСС (конвертируют ЭЛН 2.0 в ЭЛН 1.0 так, что сами же потом отказываются его принимать).

Решение лежит в плоскости: отсылать реестр 1.7.7. Для 1.7.7 ЛПУшная часть вообще не подлежит заполнению и тогда ФСС просто должно быть не на что ругаться.

Все это догадки. Нужен хотя бы протокол ошибки, чтобы было от чего отталкиваться.
В части заполняемой страхователем нет ничего ни про дату выдачи больничного ни про периоды стационара. Поэтому с нашей стороны ошибка заполнения маловероятно (но в целом я ее пока не исключаю).

Игорь, если не секрет то зачем им это в ЛС?
Чисто "на память", чтобы видеть что не забыли выплатить?
Только кажется, что это не дает гарантии, что не забыли. В ЛС строчку добавили, а реестр либо не сформировали, либо не отправили.

Пока никаких. Но вроде как еще есть время до отчетности

На основании чего для проф.травмы (проф.заболевания) вы пытаетесь применять положения 255-ФЗ, которые касаются совсем других пособий?
Открываем 125-ФЗ, статью 9 
1. Пособие по временной нетрудоспособности в связи с несчастным случаем на производстве или профессиональным заболеванием выплачивается за весь период временной нетрудоспособности застрахованного до его выздоровления или установления стойкой утраты профессиональной трудоспособности в размере 100 процентов его среднего заработка, исчисленного в соответствии с Федеральным законом от 29 декабря 2006 года N 255-ФЗ "Об обязательном социальном страховании на случай временной нетрудоспособности и в связи с материнством".
2. Максимальный размер пособия по временной нетрудоспособности в связи с несчастным случаем на производстве или профессиональным заболеванием....

3. Если размер пособия по временной нетрудоспособности в связи с несчастным случаем на производстве или профессиональным заболеванием, исчисленный из среднего заработка застрахованного, превышает максимальный размер пособия по временной нетрудоспособности...

Где вы тут видите про "не меньше МРОТ"?
п.6.1 статьи 14 255-ФЗ касается размера пособий по временной нетрудоспособности, по беременности и родам, ежемесячного пособия по уходу за ребенком. Проф.заболевание и травма определяются 125-ФЗ. Только средний заработок считается одинаково.

Я согласен, что законодатели непоследовательны. Но с точки зрения буквы закона нет оснований применять правило "не меньше МРОТ" для травматизма и проф.заболеваний.

Экономить на спичках надо там, где это позволяет закон. А не трактовать закон так как им удобно для экономии.
На основании чего они решили, что если расчет зарплаты (именно действие по начислению зарплаты) идет после даты смерти, то страховые не начисляются? Если они проводят аналогию с НДФЛ, то совершенно напрасно. Это у НДФЛ дата получения дохода для большей части дохода - день когда доход выплачивается. У страховых нет такого. У страховых имеет значение "бухгалтерский" месяц когда идет начисление зарплаты, а не дата на календаре.

Разберем на примере: человек был жив до 31.01 включительно. Умер 02.02.
Если я рассчитываю зарплату 01.02 - страховые есть, если я считаю зарплату 03.02 - страховых нет?
Ню-ню. Такую трактовку я еще не встречал.
Даже заинтересовался: а у них где-то в локальных документах зафиксирована конкретная дата, когда они должны выполнить расчет зарплаты? 
Если даже не вдаваться в правомочность такого подхода, на месте инспектора я бы в этом случае как минимум поинтересовался чей-то они не рассчитали зарплату 01.02 и трактовал откладывание расчета на 03.02 как уклонение от уплаты страховых, со всеми вытекающими.
А еще бы ткнул их носом в их собственное заполнение РСВ и индивидуальных карточек по работникам, которое говорит о том, что январская зарплата таки начисляется в январе не смотря на то, что на календаре был февраль.
Ну то есть примитивно: покажите мне индивидуальную карточку на умершего работника. Мне показывают и я вижу что в январе база не нулевая. Без дальнейших разбирательств впаиваю штраф за то, что не начислили страховые при ненулевой базе страховых.

На вкладку "застрахованное лицо", вроде как точно только отсюда.
"ЭЛН Заполняется работодателем" в некоторых сценариях работы возможно было заполнение тем значением что ставит МО в ЭЛН.
Интерфейс кадровой части не важен.

Все просто. В поставке травматизм по людям считается без округления.
Если у человека доход 123456, то травматизм с этой суммы не 246.91 а 246.912.
Возьмите 1 человека такого. Получите в своде 246.91.
Возьмите 3 таких человек. Получите в своде не 246.91*3=740,73, а 740.74

Не согласны с этим - включайте округление до копеек взносов по травматизму.
Только учтите что травматизм начисляется не почеловечно как остальные страховые, а с общего ФОТ организации.

В примере выше ФОТ на 3 человек это 370368, а травматизм с ФОТ это 740.736 = 740.74. А не 740,73.

В подтверждении того, что неплохо бы в свой ФСС сходить.
Вот ответ Пермского:
Так как Пермское РО вступили в прямые только с 01.01.2021 , то мы запрашиваем документы по раннее произведённому расчету и документы, подтверждающие право на перерасчёт на бумажном носителе.Далее через Арм ввода заносим первичный расчёт и уже после перерасчёт

Как я понял, пермский ФСС сам заводит такие пособия в систему (кажется это более безошибочный способ).